Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Apoc2Q05020 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms