Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox8Q04886 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox8Q04886 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms