Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smpd1Q04519 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpd1Q04519 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms