Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CkbQ04447 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CkbQ04447 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms