Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scg2Q03517 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms