Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gjb4Q02738 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb4Q02738 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms