Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RykQ01887 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RykQ01887 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RykQ01887 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RykQ01887 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RykQ01887 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RykQ01887 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms