Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1cQ01815 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms