Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mc1rQ01727 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mc1rQ01727 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms