Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HmgcrQ01237 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HmgcrQ01237 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms