Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pde1bQ01065 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pde1bQ01065 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms