Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
F8a1Q00558 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
F8a1Q00558 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms