Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Flt3Q00342 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Flt3Q00342 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms