Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scn1bP97952 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms