Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VegfdP97946 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VegfdP97946 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms