Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smn1P97801 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smn1P97801 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smn1P97801 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smn1P97801 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smn1P97801 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smn1P97801 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smn1P97801 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smn1P97801 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smn1P97801 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smn1P97801 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smn1P97801 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms