Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lig3P97386 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lig3P97386 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms