Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Meis3P97368 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Meis3P97368 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Meis3P97368 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms