Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mesp1P97309 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms