Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arf1P84078 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf1P84078 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms