Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gbx1P82976 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms