Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irx2P81066 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irx2P81066 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms