Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kifap3P70188 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Kifap3P70188 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Kifap3P70188 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kifap3P70188 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms