Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SbdsP70122 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SbdsP70122 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SbdsP70122 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms