Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta1P68134 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta1P68134 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms