Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3aP63011 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms