Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba52P62984 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba52P62984 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms