Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps27aP62983 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps27aP62983 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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