Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gabra1P62812 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gabra1P62812 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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