Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pou3f4P62515 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pou3f4P62515 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pou3f4P62515 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pou3f4P62515 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms