Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b6P59708 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms