Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms