Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lim2P56563 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lim2P56563 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lim2P56563 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms