Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CckbrP56481 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms