Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CdaP56389 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CdaP56389 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdaP56389 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdaP56389 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdaP56389 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdaP56389 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CdaP56389 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CdaP56389 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CdaP56389 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CdaP56389 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CdaP56389 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CdaP56389 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms