Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Defb1P56386 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms