Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
StomP54116 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
StomP54116 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
StomP54116 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
StomP54116 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
StomP54116 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms