Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cux1P53564 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms