Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ube2e3P52483 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2e3P52483 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms