Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClgnP52194 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClgnP52194 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms