Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cxcl5P50228 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl5P50228 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms