Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Prox1P48437 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prox1P48437 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms