Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Abcd1P48410 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Abcd1P48410 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms