Protein–RNA interactions for Protein: P47968

Rpia, Ribose-5-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpiaP47968 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpiaP47968 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms