Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt1P46096 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt1P46096 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt1P46096 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms