Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlx1P43345 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlx1P43345 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms