Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk1P41969 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Elk1P41969 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Elk1P41969 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Elk1P41969 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms