Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mmp9P41245 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp9P41245 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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