Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfc1P35601 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfc1P35601 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms