Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms